集装箱进水的原因主要有以下几种情况：货物自带、箱体凝结、海水入浸、淡水入浸。
1、货物自带
湿气或水分随货物一起被带入集装箱，举个例来说，如果一个集装箱内装了5吨的家具，家具本身就会含有大概8%到25%的湿度，根据木材类型、家具干燥处理程度的不同而有所不同。这相当于大约400-1250升的水。这里边的湿气有些就会散发到集装箱内的空气中，成为集装箱水汽凝结的一个重要来源。
2、箱体凝结
在集装箱远洋运输或存储过程中，货柜往往会经历高温气候及较强的昼夜温差变化，温度变化会在0-8摄氏度，湿度会高达98%，这就是凝露现象，当温度为30度时，空气中水含量为30.4g每平方米。当温度由30摄氏度降低到18摄氏度，水蒸气就会凝结成水滴，若是40英尺货柜则产生1000克的冷凝水，就会造成“集装箱雨”。
3、海水入浸
常在海上漂，哪能不湿箱？如果遇到大风大浪，如果恰好箱体有小损伤，如果又在甲板上，或者遭遇海上事故，落入海里，那进海水或潮湿是没办法的，这个不多说。
4、淡水入浸
箱子顶板或侧板、前板、门板、门胶条等有破损的话，下雨雪时或船舶淡水管道破裂等都会导致进水。近期台风密集，大江南北狂风暴雨，发货时更要预防进水问题。
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